医学院在国内大学中占有相对重要地位，下面按照目前我国社会普遍认可的一些指标和数据进行排名。主要参考的指标和数据有:
    （1）七年制、八年制临床医学专业授予情况；
    （2）相关学科(生物、化学)的全国排名情况；
    （3）学校在国内和国际的名气程度；
    （4）博士点/硕士点(二级学科)、国家重点学科、国家精品课程的情况；
    （5）两院院士、长江学者、博士生导师的情况；
    （6）附属或教学医院、附属科研院所的情况；
    （7）学生入学成绩情况、地域优势。
    2010年医学院具体排名如下（满分1000分）:
    1、清华大学（原中国协和医科大学）——总分：990分
    2、北京大学（原北京医科大学）——总分：945分
    3、复旦大学（原上海医科大学）——总分：921分
    4、上海交通大学（原上海第二医科大学）——总分：848分
    5、中山大学（原中山医科大学）——总分：746分
    6、华中科技大学（原同济医科大学）——总分：724分
    7、浙江大学（原浙江医科大学）——总分：703分
    8、四川大学（原华西医科大学）——总分：609分
    9、中南大学（原湖南医科大学）——总分：602分
    10、南方医科大学（原第一军医大学）——总分：477分
    11、首都医科大学——总分：472分
    12、山东大学（原山东医科大学）——总分：455分
    13、中国医科大学——总分：448分
    14、哈尔滨医科大学——总分：428分
    15、吉林大学（原白求恩医科大学）——总分：419分
    16、武汉大学（原湖北医科大学）——总分：407分
    17、南京医科大学——总分：394分
    18、天津医科大学——总分：392分
    19、西安交通大学（原西安医科大学）——总分：362分
    20、重庆医科大学——总分：360分
    21、北京中医药大学——总分：358分
    22、广州中医药大学——总分：341分
    23、郑州大学（原河南医科大学）——总分：308分
    24、苏州大学（原苏州医学院）——总分：292分
    25、中国药科大学——总分：265分（药学）
    26、南京大学——总分：259分
    27、沈阳药科大学——总分：250分（药学）
    28、河北医科大学（原河北医学院和河北中医学院）——总分：245分
    29、上海中医药大学——总分：235分
    30、成都中医药大学——总分：234分
    31、广西医科大学——总分：228分
    32、南京中医药大学——总分：217分
    33、黑龙江中医药大学——总分：207分
    34、同济大学（原上海铁道医学院）——总分：197分
    35、新疆医科大学（原新疆医学院和新疆中医学院）——总分：190分
    36、天津中医药大学——总分：189分
    37、福建医科大学——总分：187分
    38、山东中医药大学——总分：186分
    39、东南大学（原南京铁道医学院）——总分：183分
    40、大连医科大学——总分：182分
    41、南开大学——总分：181分
    42、山西医科大学——总分：163分
    43、湖南中医药大学——总分：158分
    44、安徽医科大学——总分：149分
    45、辽宁中医药大学——总分：147分
    46、暨南大学——总分：143分
    47、浙江中医药大学——总分：135分
    48、湖北中医学院——总分134分
    49、兰州大学（原兰州医学院）——总分：123分
    50、青岛大学（原青岛医学院）——总分：115分
    51、温州医学院——总分：112分
    52、厦门大学（原厦门医学院）——总分：109分
    53、中国海洋大学医药学院——总分：105分（药学）
    54、广州医学院——总分：89分
    55、汕头大学（原汕头医学院）——总分：88分
    56、福建中医学院——总分：86分
    57、南昌大学（原江西医学院）——总分：85分
    58、华东理工大学药学院——总分：73分（药学）
    59、延边大学（原延边医学院）——总分：64分
    60、昆明医学院——总分：55分
    61、长春中医药大学——总分：29分
    62、福州大学化学化工学院——总分：21分（药学）
    63、青海大学（原青海医学院）——总分：20分
    64、南华大学（原衡阳医学院）——总分：16分
    65、西北大学化工学院——总分：14分（药学）
    66、江苏大学（原镇江医学院）——总分：11分
    67、贵阳医学院——总分：9分
    68、哈尔滨商业大学药学院——总分：8分（药学）
    69、浙江工业大学药学院——总分：8分（药学）
    70、扬州大学（原扬州医学院）——总分：6分
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